2017年3月10，中科院马普所王泽峰研究员在Cell Research在线发表了题为“Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine”的研究论文。 该论文一出现，便激起千层浪！又是circular RNA又是N6-methyladenosine，满满的热点词汇。
        仅看标题，这篇文章赤裸裸的探讨了一个崭新的发现：环状RNA（小编以为这货不编码蛋白的呀！）可作为信使RNA来编码蛋白，但这个编码过程需要RNA甲基化修饰m6A（是什么来着？感觉很高级！）来驱动。
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背景
        关于环状RNA: 环状RNA（circRNA）在某些病毒中普遍存在，然而近年来的二代测序技术辅助研究者发现这类RNA也大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成，具有闭合环状结构，非常稳定。这类RNA的具体功能尚不明确，但一直被归属为非编码RNA，在2013年的《自然》(Nature)杂志上,两篇重要的研究论文揭示出一些环状RNA可以充当分子“海绵”,结合并封闭了microRNAs/RNA结合蛋白，从而调控基因表达。
 
       关于RNA m6甲基化(N6-methyladenosine)修饰，需要了解4张ppt：

 
 
 
        关于RNA的翻译： 人体中mRNA的5’帽子结构是大部分mRNA翻译所必需的。但有些mRNA可以不依赖于帽子结构，而靠一个叫IRSE（内部核糖体进入位点）的順式调控原件从mRNA的中间启动翻译。例如，人工构建的含内部核糖体进入位点的环状RNA，可以在体内和体外表达出蛋白质。
 
研究内容
1在前期工作中，研究者发现带有IRES的环状RNA可以在细胞中被翻译。

2 本研究发现某些没有IRSE的阴性对照mini gene也可以翻译，通过序列对比发现，这些阴性对照在翻译起始位点附近都有一个RRACH fragment (R= G or A; H = A, C or U)，而这个序列恰好就是RNA m6A修饰的识别特征序列。通过基因组的序列对比，研究者发现：环状RNA比编码RNA携带更多的m6A修饰识别序列。

3 环状RNA m6A修饰水平的高低可以影响环状RNA的翻译效率。
4 m6A驱动环状RNA翻译，需要m6A识别蛋白YTHDF3结合到环状RNA的修饰位点并募集eIF4G2和其他翻译起始因子。
5 基于二代测序实验（circRNA-m6A-seq)，计算机预测和质谱数据库分析比对，研究者发现细胞内部分环状RNA的确处于多核糖体结合状态，提示部分内源性的环状RNA的确行使翻译蛋白的功能。此外，基于数据库比对结果，该研究鉴定出一些由环状RNA编码的新肽段。

研究结论

• m6A识别蛋白YTHDF3能够结合到环状RNA的m6A修饰位点并募集eIF4G2和其他翻译起始因子来驱动环状RNA的翻译，甲基转移酶METTL3/14可以促进这个过程，而脱甲基酶FTO可以抑制这个过程。

本研究的意义

• m6A驱动环状RNA被翻译成蛋白质的过程，表明所谓的编码RNA和非编码RNA界定不是绝对的。
• 提出更重要的研究方向：

                1. 环状RNA编码的蛋白具有何种功能？
                2.mRNA存在很多m6A修饰富集区，是否意味着mRNA可翻译出多种蛋白质？
 
        创新发现，离不开技术平台的进步，正如针对m6A修饰的RNA二代测序实验在本研究中的作用不可或缺。目前，天昊生物已经完成（m6A）RNA甲基化测序（MeRIP-Seq）的技术研发工作，以期帮助科研工作者对m6A修饰进行深入的研究。
 

• 天昊（m6A）RNA甲基化测序（MeRIP-Seq）是怎样的一个技术平台？

        MeRIP-seq是将ChIP-seq与RNA-seq相结合的研究手段，通过Poly(A)富集mRNA+抓取(特异抗体抓取被m6A甲基化修饰的mRNA片段) +测序（对抓取的mRNA进行二代测序），实现对特定状态下特定组织中全部表达的mRNA上m6A修饰位点的检测。

• 天昊生物MeRIP-Seq技术平台细节

 
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