盘点 | 天昊生物专利技术--Accu16S细菌与AccuITS真菌绝对定量测序客户文章汇总（医学篇）

原创上海天昊生物

随着天昊生物专利技术--Accu16S^®细菌与AccuITS^TM真菌绝对定量测序项目的大量积累，客户文章的发表也迎来了一波新的高潮！这说明天昊生物绝对定量专利技术已经得到了科研市场的充分肯定和医学、农学、环境、生态和食品等多个研究领域高水平杂志的广泛认可。年中将至，今天小编就和大家来盘点一下天昊绝对定量测序在医学领域取得的成绩。

绝对定量测序客户代表文章导览

❶“肠-骨轴”调控股骨头坏死机制重大发现

❷帕金森病与肠道菌群新成果

❸阴道炎治疗与肠道菌群研究

❹头颈癌与肠道菌群研究

❺骨质疏松症与肠道菌群研究

❻肝细胞癌与肠道菌群研究

❼肠道菌群体外发酵研究

❽金针菇多糖抗炎与肠道菌群研究

❾益生元与人体肠道菌群研究

代表文章1：

“肠-骨轴”调控股骨头坏死机制重大发现

中文题目：糖皮质激素诱导的肠道有益菌胞外囊泡的减少与骨坏死发病相关

发表期刊：Science Advances

影响因子：14.957

发表时间：2022年4月

研究目的：探究肠道菌群在糖皮质激素诱导股骨头坏死中的作用

样本类型：小鼠粪便

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：2个分组x2种处理x3个重复，共12个

研究内容：

研究者收集了来自糖皮质激素类药物甲泼尼龙处理(MPS)和对照(Vehicle)的常规饲养（Non-Ch）和同窝饲养（Ch）雄性小鼠的粪便样品，进行了Accu16S^®细菌绝对定量测序，分析肠道菌群差异，寻找起到骨保护作用的关键有益微生物。

研究结论：

在这项研究中，作者通过巧妙的实验设计及详实可信的结果，首次发现了肠道菌群中的有益菌L. animalis可通过向宿主传递功能性胞外囊泡发挥骨保护作用，糖皮质激素导致的L. animalis及其胞外囊泡的减少与股骨头坏死发病相关，为该病的防治提供了新的思路。

摘自原文图3：与健康小鼠同窝饲养缓解了糖皮质激素导致的L. animalis减少，移植L. animalis可对抗糖皮质激素导致的股骨头坏死。

>>查看全文解读

喜讯！天昊Accu16S细菌绝对定量技术助力客户股骨头坏死研究登陆Science子刊《Science Advances》

代表文章2：

帕金森病与肠道菌群新成果

中文题目：利用网络药理学与细菌绝对定量相结合的方法探讨天芪平颤颗粒抗6-OHDA诱发大鼠帕金森病的作用机制

发表期刊：Frontiers in Nutrition

影响因子：6.590

发表时间：2022年5月

研究目的：探讨天芪平颤颗粒（TPG）治疗帕金森病(PD)的机制

样本类型：大鼠粪便

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：3个分组 x 4个重复，共12个

研究内容：

研究利用6-羟基多巴胺(6-OHDA)注入成年雄性大鼠右脑来建立PD大鼠模型。所有大鼠随机分为三组Sham组、PD组和TPG组，每组4只。TPG组大鼠每天灌胃TPG一次，对照Sham组和PD组大鼠用无菌生理盐水灌胃。收集大鼠粪便，进行Accu16S^®细菌绝对定量测序检测。此外，还利用大鼠血液样本，通过ELISA实验分析了血清炎性细胞因子的浓度，并利用免疫组化实验，观察了大鼠脑组织中小胶质细胞增生和星形胶质细胞增生的情况。

研究结论：

本研究通过网络药理学和大鼠肠道菌群等实验相结合的方法，鉴定了与PD相关的73个化合物和235个靶基因。根据通路富集分析及16S rRNA测序结合的方法，验证了TPG可以改善肠道菌群，抑制PD的炎症反应，成功揭示了TPG在抗PD中的作用机制。

摘自原文图6：不同处理大鼠肠道菌群组成差异：（A-C）在纲水平的绝对丰度差异；(D-F)在目水平上的绝对丰度差异；(G-I)在科、属和种水平上的绝对丰度差异。

>>查看全文解读

专利技术新文 | 天昊Accu16S细菌绝对定量测序专利技术在帕金森病研究中的新进展

代表文章3：

阴道炎治疗与肠道菌群研究

中文题目：准确的16S绝对定量测序揭示复方芙蓉泡腾栓治疗混合性阴道炎的阴道微生态组成和动态

发表期刊：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

影响因子：6.073

发表时间：2022年5月

研究目的：探讨复方芙蓉泡腾栓在治疗混合性阴道炎中对阴道微生态组成和动态的影响

样本类型：阴道拭子

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：2个治疗组 x 3个治疗阶段 x 多重复，共80名患者获得的204个样本

研究内容：

本研究将患者随机分为两组：阳性对照组（C组：克林霉素磷酸酯乳膏-克林霉素组）和实验组（T组：复方芙蓉泡腾栓-芙蓉组）。筛选期设定为基线（V1阶段：-2-0天），两组患者连续用药12天（每晚1次）。在治疗期后3-5天（V2阶段：15-17天）和治疗期后28±3天（V3阶段：40±3天）回医院检测。每次回访，参与者接受了常规实验室检查，并取两份阴道拭子，一份用于Nugent和Donders的评分，另一份保留在-80ºC，用于Accu16S^®细菌绝对定量测序。

研究结论：

本研究发现，Accu16S^®细菌绝对定量测序技术在准确评估阴道微生物组的动态和治疗期间的药物效果方面优于传统的相对定量RQS方法。实验结果证明，复方芙蓉泡腾栓治疗AV+BV的疗效与克林霉素相同，可以很好地促进阴道微生态的恢复。

摘自原文图4：克林霉素组和芙蓉组在属(A)和种(B)水平上主要分类群的相对和绝对丰度。(Ta、Tb和Tc分别代表芙蓉组的V1、V2和V3阶段；Ca、Cb和Cc分别代表克林霉素组的V1、V2和V3阶段）。

>>查看全文解读

项目新文：天昊Accu16S细菌绝对定量测序在中药治疗阴道炎研究中的新成果

代表文章4：

头颈癌与肠道菌群研究

中文题目：利用定量微生物图谱分析来比较口咽、下咽鳞状细胞癌及其邻近组织中的微生物

发表期刊：Journal of Oral Microbiology

影响因子：5.833

发表时间：2022年5月

研究目的：探讨使用绝对定量方法来评估头颈癌不同样本类型微生物多样性差异

样本类型：组织样本和口咽拭子样本

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：3种样本 x 27个重复

研究内容：

本研究收集了27名下咽鳞状细胞癌(HPSCC)患者的下咽癌组织(HC)、癌旁组织(AT)和口咽粘膜拭子(OPM)这三种不同的样本。使用两个拭子对口咽粘膜(OPM)上的微生物进行采样，刮取共20 mg的癌及癌旁组织，样品快速储存在-80ºC，用于Accu16S^®细菌绝对定量测序。

研究结论：

本研究结果发现，与HC和AT组相比，OPM组的菌群呈现出多样性较低的特点。细菌绝对定量（QMP）补充了传统的相对定量（RMP）结果，发现了与RMP相反的数据，展示了QMP更加全面性的优势。在QMP分析下HC组进行分类，发现在晚期T分类和TNM分期中，属水平的存在更多的Fusobacterium、Parvimonas和Dialister。研究表明，口咽拭子可能是一种有用的非侵入性替代活检的方法，用于HPSCC中微生物的评估。

摘自原文图3：微生物相对丰度与绝对丰度的网络重建图。

>>查看全文解读

祝贺！天昊Accu16S细菌绝对定量技术助力客户头颈癌研究新发现

文章代表5：

骨质疏松症与肠道菌群研究

中文题目：高通量绝对定量测序揭示汉族老年人骨质疏松症相关肠道微生物的变化

发表期刊：Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

影响因子：6.073

发表时间：2021年4月

研究目的：探讨肠道微生物与骨质疏松症风险的关系

样本类型：人类粪便

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：44名骨质疏松症患者和64名对照者

研究内容：

本研究利用Accu16S^®细菌绝对定量测序对44例骨质疏松症患者和64名对照者粪便细菌的绝对和相对丰度进行了检测，结合研究者之前对175个样本的相对丰度一同进行了分析。

研究结论：

本研究结果发现，与对照组相比，骨质疏松症患者体内Bacteroides属和Eisenbergiella属的绝对和相对丰度较高。肠道微生物的组成可能会增加骨质疏松的风险。本研究为异常肠道微生物菌群在骨质疏松症发病中的潜在作用提供了流行病学证据。

摘自原文图2：骨质疏松症组和对照组在门(A)和属(B)水平的主要分类群的相对和绝对丰度。

>>查看全文解读

医学、农学新应用，天昊Accu16S细菌绝对定量测序技术在骨质疏松和农业复垦领域收获新文

文章代表6：

肝细胞癌与肠道菌群研究

中文题目：粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子可以通过改善肠道失调和减轻炎症来保护小鼠免受肝细胞癌侵害

发表期刊：World Journal of Gastroenterology

影响因子：5.374

发表时间：2020年9月

研究目的：探讨粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子是否能够通过肠道菌群来保护小鼠免受肝细胞癌（HCC）侵害

样本类型：小鼠粪便

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：3个分组共36个

研究内容：

本研究将36只雄性小鼠分为3组：对照组（n=10）、HCC组（n=13）和HCC+GM-CSF组（GM-CSF过表达，n=13）。实验利用HCC细胞建立了GM-CSF正常和过表达的HCC原位移植瘤模型。确定了肝损伤、系统性炎症和肠屏障功能。使用Accu16S^®细菌绝对定量测序和气相色谱-质谱（GC-MS）分析粪便微生物组和代谢组学特征。

研究结论：

本研究结果显示GM-CSF过表达显著影响HCC小鼠的肠道微生物群。同样，GM-CSF过度表达导致粪便中生物素和油酸水平显著增加，粪便中琥珀酸、腺苷、富马酸、硫辛酸和马来酸水平显著降低。GM-CSF诱导的肠道微生物群和粪便代谢物主要参与减轻炎症反应、生物素代谢和肠屏障功能障碍有关的途径。结果表明GM-CSF对HCC发展具有保护作用，这些作用可能是由GM-CSF对免疫的调控进而影响肠道微生物及其代谢产物来实现的。这项研究为HCC的治疗提供了新的见解。

摘自原文图6：对照组、HCC组和HCC+GM-CSF组之间的代表性微生物属，特征代谢物，环境因子（肝脏和肠道损伤指数）的相关性分析。

>>查看全文解读

天昊16S扩增子绝对定量测序项目新文：粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子通过改善肠道失调和减轻炎症来保护小鼠免受肝细胞癌侵害

代表文章7：

肠道菌群体外发酵研究

中文题目：三种双歧杆菌的共生关系导致双歧杆菌在含有唾液酸化免疫球蛋白G的人类肠道菌群体外发酵中数量增加

发表期刊：Journal of Agricultural and Food Chemistry

影响因子：5.895

发表时间：2020年8月

研究目的：采用体外厌氧发酵法研究了唾液酸化免疫球蛋白G（IgG）对肠道菌群的影响

样本类型：人类粪便体外发酵液

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V4区）

取样策略：4个分组x3个重复，共12个

研究内容：

本研究从5名健康成年志愿者（3名男性和2名女性）获取新鲜粪便样本用于发酵。之后利用Accu16S^®细菌绝对定量测序，分别对粪便未发酵组（OR组）；体外发酵24小时，添加葡萄糖作为唯一的碳源组（G组）；体外发酵24 h，添加唾液酸化的IgG作为唯一的碳源组（SG组）和体外发酵24 h，添加非唾液酸化的IgG作为唯一碳源组（IG组）样本进行检测。

研究结论：

添加唾液酸化IgG能显著促进双歧杆菌的生长。三种双歧杆菌种被成功分离，并在唾液酸化IgG培养基中表现出共培养生长特性，游离单糖和N-聚糖结构的变化也支持了这一特性。这些结果表明，双歧杆菌体外发酵的增加是由于三种双歧杆菌利用唾液酸化IgG释放的糖而形成了共生关系。

摘自原文图2：LEfSe分析（a）、属水平群落结构柱状图（b）和属水平上的益生菌和病原体的相对丰度（c）。

>>查看全文解读

天昊16S扩增子绝对定量测序项目新文：三种双歧杆菌共生关系导致双歧杆菌在含有唾液酸化免疫球蛋白G的人类肠道菌群体外发酵中数量增加

代表文章8：

金针菇多糖抗炎与肠道菌群研究

中文题目：金针菇β-型糖苷多糖对结肠炎小鼠的抗炎及肠道菌群调节作用

发表期刊：Food & Function

影响因子：6.317

发表时间：2020年5月

研究目的：探讨金针菇多糖（FVP）对结肠炎小鼠抗炎及肠道菌群的影响

样本类型：小鼠粪便

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：4个分组x12个重复，共48个

研究内容：

本研究将48只小鼠随机分为4组（SD、SD-FVP、DSS、DSS-FVP）：SD组和SD-FVP组在实验期间给予纯水。在DSS组和DSS-FVP组，在第7-11、18-22、29-33、41-44天用1.5%葡聚糖硫酸钠（DSS）盐代替纯水。SD-FVP和DSS-FVP组在实验期间每天灌胃给予FVP。在SD、DSS组，小鼠灌胃给予蒸馏水作为对照。每天灌胃给药，所有小鼠都每周记录饲料消耗量。疾病活动指数（DAI）评分由体重减轻程度、大便稠度和便血情况决定。最后处死小鼠后，测量结肠长度，取血清及各脏器，于-80℃保存至检测。利用Accu16S^®细菌绝对定量测序对小鼠粪便进行检测。

研究结论：

本研究结果发现，FVP治疗可减轻溃疡性结肠炎（UC）症状，上调或下调结肠组织中相关基因表达水平，并可增强UC小鼠的代谢和生物合成能力。采用相关性分析发现对11种肠道微生物包括乳酸杆菌、双歧杆菌和梭状芽孢杆菌与UC症状相关。这些结果表明，FVP可通过调节特定肠道微生物而减轻小鼠UC症状，提高了对FVP作为益生元的功能活性的认识。

摘自原文图8：科水平小鼠肠道微生物组成。

>>查看全文解读

天昊16S扩增子绝对定量测序项目新文：金针菇β-型糖苷多糖对结肠炎小鼠的抗炎及肠道菌群调节作用

代表文章9：

益生元与人体肠道菌群研究

中文题目：绿刺参岩藻糖基硫酸软骨素的链构象、理化性质及其体外发酵

发表期刊：Carbohydrate Polymers

影响因子：10.723

发表时间：2020年1月

研究目的：探讨绿刺参岩藻糖基硫酸软骨素(fCS-Sc)的对人体肠道菌群的影响

样本类型：人类粪便体外发酵液

检测方法：Accu16S^®细菌绝对定量测序（V3-V4区）

取样策略：3个分组x3个重复，共9个

研究内容：

将fCS-Sc或低聚果糖（FOS，阳性对照）溶于培养基中，高压灭菌。新鲜粪便样本来自三名捐赠者（2名女性和1名男性）。将每个供者的相同量粪便样本混合，用PBS稀释成粪浆，将9ml空白培养基（对照组）或含fCS-Sc或FOS的培养基与1ml粪浆混合。将混合物立即放入厌氧培养箱中制备发酵液。

研究结论：

fCS-Sc可以通过提高肠道菌群的绝对丰度来调节肠道菌群的群落结构，增加有益菌，抑制病原微生物，从而促进短链脂肪酸的产生。本研究进一步加深了对fCS-Sc空间结构的认识，以及fCS-Sc作为益生元的应用。

摘自原文图6：主要细菌在门（a）和属（b）水平上的相对丰度和绝对丰度。

>>查看全文解读

又一篇！天昊生物微生物16S扩增子绝对定量测序技术再发好文

天昊生物

Accu16S^®细菌与AccuITS^TM真菌绝对定量测序

专利技术简介

天昊生物一直秉承“自主研发、创新驱动”的发展理念，在微生物多样性检测领域潜心研发多年，率先于2019年和2021年在国内市场成功推出了Accu16S^®细菌和AccuITS^TM真菌绝对定量测序技术服务，并顺利申请了国家技术专利。我们的微生物绝对定量技术完美的解决了国内同类相对定量扩增子测序服务“只测比例，不知数量”的技术痛点，一个样本单次检测，即可同时获得样本微生物多样性的“相对比例”和“绝对数量”，让样本总菌和特定菌种的绝对数量结果唾手可得。

我们的服务一经推出，便获得了客户和市场的高度认可。截至目前，公司检测项目累计已达数百项，客户发表SCI文章32篇，其中1区文章高达10篇，5分以上文章也达到了23篇，这些数据充分说明天昊生物绝对定量专利技术已经得到了高水平杂志的普遍认可，在微生物多样性绝对定量检测领域处于国内领先地位。

相关链接：

浅谈：论微生物绝对定量VS相对定量的优越性；

专属含PCR抑制剂的环境样本微生物拷贝数定量的最佳解决方案!；

向“真”而生！天昊生物AccuITS真菌绝对定量测序服务重磅上线；

The ISME Journal：为什么微生物相对定量不能代替绝对定量；

咨询沟通请联系

18964693703（微信同号）

创新基因科技，成就科学梦想