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一
加载R包
In [1]:
library(ggplot2)
二
数据读取
data = read.table('alpha.diversity.index.xls',header = T,sep = ' ',row.names = 1)head(data)
三
绘图
In [5]:
apply(data,2,function(x){ df = data.frame(x,group=rep(c('A','B','C','D'),each = 6),sub_group=as.factor(rep(1:6,times = 4)))
ggplot(data = df,aes(x=group,y=x,fill=group)) +
geom_boxplot() + geom_point(aes(colour=sub_group),size=4) +
geom_line(aes(group=sub_group,colour=sub_group) ,size=0.8,) })
Out[5]:
往期相关链接：
1、R基础篇
excel不熟练怎么办，R来帮您（一）数据分类汇总；
如何使用Rstudio练习R基础教程；
R相关软件及R包安装；
【零基础学绘图】之气泡图绘制（六）；
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2、R进阶
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【绘图进阶】之六种带中心点的PCA 图和三维PCA图绘制（四）；
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3、数据提交
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4、表达谱分析
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5、医学数据分析
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作者：大熊
审核：有才
来源：天昊生信团
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